Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph6aQ8CDR2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph6aQ8CDR2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms