Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrrn3Q8CBC6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Lrrn3Q8CBC6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms