Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spef2Q8C9J3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spef2Q8C9J3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spef2Q8C9J3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms