Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ccdc113Q8C5T8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc113Q8C5T8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc113Q8C5T8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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