Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfrp1Q8C4U3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms