Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Amigo3Q8C2S7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Amigo3Q8C2S7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
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