Protein–RNA interactions for Protein: Q8C165

Pm20d1, N-fatty-acyl-amino acid synthase/hydrolase PM20D1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d1Q8C165 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pm20d1Q8C165 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pm20d1Q8C165 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pm20d1Q8C165 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms