Protein–RNA interactions for Protein: Q8C033

Arhgef10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,345 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef10Q8C033 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Arhgef10Q8C033 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Arhgef10Q8C033 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Arhgef10Q8C033 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Arhgef10Q8C033 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgef10Q8C033 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arhgef10Q8C033 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms