Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Iffo1Q8BXL9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Iffo1Q8BXL9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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Iffo1Q8BXL9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Iffo1Q8BXL9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Iffo1Q8BXL9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Iffo1Q8BXL9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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