Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rbbp5Q8BX09 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rbbp5Q8BX09 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms