Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ctdsp2Q8BX07 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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