Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Catsper4Q8BVN3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Catsper4Q8BVN3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms