Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmod1Q8BVA4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmod1Q8BVA4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms