Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

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Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Gga3Q8BMI3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gga3Q8BMI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gga3Q8BMI3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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