Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gpc2Q8BKV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc2Q8BKV1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms