Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tnrc6bQ8BKI2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms