Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gabra5Q8BHJ7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gabra5Q8BHJ7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms