Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Htatsf1Q8BGC0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Htatsf1Q8BGC0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms