Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG30

Nelfa, Negative elongation factor A, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfaQ8BG30 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NelfaQ8BG30 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NelfaQ8BG30 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms