Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Jmjd4Q8BFT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Jmjd4Q8BFT6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Jmjd4Q8BFT6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms