Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc172Q810N9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc172Q810N9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms