Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ChfrQ810L3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ChfrQ810L3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms