Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cldn34b3Q80ZS5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms