Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pkhd1l1Q80ZA4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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