Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z96

Vangl1, Vang-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl1Q80Z96 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vangl1Q80Z96 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vangl1Q80Z96 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms