Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5bQ80Y84 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Kdm5bQ80Y84 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kdm5bQ80Y84 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms