Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg2bQ80XK6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg2bQ80XK6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms