Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Abcc12Q80WJ6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Abcc12Q80WJ6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms