Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ctdp1Q7TSG2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ctdp1Q7TSG2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms