Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actn1Q7TPR4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actn1Q7TPR4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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