Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prrc2bQ7TPM1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prrc2bQ7TPM1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms