Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SyncripQ7TMK9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SyncripQ7TMK9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms