Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GypcQ78HU7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GypcQ78HU7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms