Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2r2Q6ZWZ2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ube2r2Q6ZWZ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms