Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RfflQ6ZQM0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RfflQ6ZQM0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms