Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nup188Q6ZQH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nup188Q6ZQH8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms