Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nemp1Q6ZQE4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nemp1Q6ZQE4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms