Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NinlQ6ZQ12 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NinlQ6ZQ12 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
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