Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LcorQ6ZPI3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms