Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cxcl3Q6W5C0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cxcl3Q6W5C0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms