Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn5Q6VZZ7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Opn5Q6VZZ7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms