Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift172Q6VH22 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift172Q6VH22 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms