Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc88cQ6VGS5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc88cQ6VGS5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms