Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Slc9c1Q6UJY2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Slc9c1Q6UJY2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms