Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L9

Shc4, SHC-transforming protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc4Q6S5L9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Shc4Q6S5L9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shc4Q6S5L9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms