Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Med16Q6PGF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Med16Q6PGF3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms