Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HjurpQ6PG16 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HjurpQ6PG16 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms