Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfrlQ6PE55 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfrlQ6PE55 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms