Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Taf1cQ6PDZ2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Taf1cQ6PDZ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms