Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vstm2lQ6PDS0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm2lQ6PDS0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms